Tháng 3 năm 1865. Tại Hoa Kỳ, trong cuộc Nội chiến, năm người miền Bắc dám trốn chạy khinh khí cầu từ người miền nam thành phố Richmond. Một cơn bão khủng khiếp ném bốn người họ vào bờ của một hòn đảo không có người ở Nam bán cầu. Người đàn ông thứ năm và con chó của anh ta đang trốn ở biển ngoài khơi. Thứ năm này - một Cyres Smith, một kỹ sư và nhà khoa học tài năng, linh hồn và lãnh đạo của một nhóm du khách - vô tình khiến bạn đồng hành của mình căng thẳng trong nhiều ngày, người không thể tìm thấy bất cứ nơi nào mà anh ta hoặc chú chó Top dành cho anh ta. Người nô lệ trước đây phải chịu đựng hầu hết tất cả, và người hầu trung thành của Smith là Negro Nab. Trong khinh khí cầu còn có một nhà báo chiến tranh và bạn của Smith, Gideon Spilet, một người rất năng nổ và quyết đoán với đầu óc tỉnh táo; thủy thủ Pencrof, một người dám mạo hiểm và tốt bụng; Harbert Brown, mười lăm tuổi, con trai của thuyền trưởng của con tàu mà Pencroff đi thuyền, vẫn là một đứa trẻ mồ côi, và người mà thủy thủ coi là con trai của mình. Sau một cuộc tìm kiếm mệt mỏi, cuối cùng Nab cũng tìm thấy vật chủ được cứu không thể giải thích của mình, cách bờ biển một dặm. Mỗi người định cư mới của hòn đảo đều có những tài năng không thể thay thế, và dưới sự lãnh đạo của Cyres và Spilet, những người dũng cảm này tập hợp lại và trở thành một đội thống nhất. Đầu tiên, sử dụng các phương tiện đơn giản nhất trong tay, sau đó sản xuất ngày càng nhiều đối tượng lao động và đồ gia dụng phức tạp hơn trong các nhà máy nhỏ của họ, những người định cư trang bị cho cuộc sống của họ. Họ săn bắn, thu thập thực vật ăn được, hàu, và thậm chí sinh sản động vật nuôi và tham gia vào nông nghiệp. Họ sắp xếp nhà ở cho mình cao trong đá, trong một hang động được giải phóng khỏi nước. Chẳng mấy chốc, nhờ sự chăm chỉ và trí thông minh của họ, thực dân không còn biết đến nhu cầu về thức ăn, quần áo, sự ấm áp và thoải mái. Họ có tất cả mọi thứ trừ tin tức về quê hương, số phận mà họ rất lo lắng.
Một lần, khi trở về nơi ở của mình, được họ gọi là Cung điện Đá hoa cương, họ thấy rằng những con khỉ đang ở trong nhà. Sau một thời gian, như thể dưới ảnh hưởng của nỗi sợ hãi điên rồ, những con khỉ bắt đầu nhảy ra khỏi cửa sổ, và một người nào đó tay ném chiếc thang dây mà những con khỉ nuôi vào nhà. Bên trong, mọi người tìm thấy một con khỉ khác - một con đười ươi, chúng giữ và gọi chú Jupe. Trong tương lai, Jupe trở thành một người bạn, người hầu và người trợ giúp không thể thiếu cho mọi người.
Vào một ngày khác, những người định cư tìm thấy trên cát một hộp với các dụng cụ, súng, các thiết bị khác nhau, quần áo, dụng cụ nhà bếp và sách bằng tiếng Anh. Người định cư tự hỏi hộp này có thể đến từ đâu. Từ bản đồ, cũng xuất hiện trong hộp, họ thấy rằng bên cạnh hòn đảo của họ, trên bản đồ không được đánh dấu, là hòn đảo Tabor. Các thủy thủ Pencrof rất háo hức được đến với anh ta. Với sự giúp đỡ của bạn bè, anh xây dựng một bot. Khi bot đã sẵn sàng, tất cả họ cùng nhau thực hiện chuyến đi thử nghiệm quanh đảo. Trong thời gian đó, họ tìm thấy một cái chai có ghi chú nói rằng người đàn ông bị đắm tàu đang chờ được cứu trên đảo Tabor. Sự kiện này củng cố niềm tin của Pencroff, khi đến thăm một hòn đảo lân cận. Pencrof, nhà báo Gideon Spilet và Harbert ra khơi. Đến Tabor, họ phát hiện ra một lán nhỏ nơi, bằng tất cả các chỉ dẫn, không ai sống trong một thời gian dài. Họ phân tán xung quanh hòn đảo, không hy vọng nhìn thấy một người sống và cố gắng tìm kiếm ít nhất hài cốt của mình. Đột nhiên họ nghe thấy Harbert hét lên và vội vã tới sự trợ giúp của anh ta. Họ thấy Harbert đang vật lộn với một loại sinh vật khỉ. Tuy nhiên, con khỉ hóa ra là một người đàn ông hoang dã. Khách du lịch trói anh ta và vận chuyển anh ta đến đảo của họ. Họ cho anh ta một phòng riêng trong Cung điện Đá hoa cương. Nhờ sự quan tâm và lo lắng của họ, kẻ man rợ sớm biến thành một người đàn ông văn minh và kể cho họ nghe câu chuyện của mình. Hóa ra tên anh ta là Ayrton, anh ta là một cựu tội phạm, anh ta muốn chiếm hữu chiếc thuyền buồm Duncan và với sự giúp đỡ của cùng một xã hội mà anh ta biến thành một con tàu cướp biển. Tuy nhiên, kế hoạch của anh ta đã không được thực hiện và như một hình phạt mười hai năm trước, anh ta bị bỏ lại trên hòn đảo Tabor không có người ở, để anh ta nhận ra hành động của mình và chuộc lại tội lỗi của mình. Tuy nhiên, chủ sở hữu của "Duncan" Eduard Glenarvan nói rằng một ngày nào đó anh sẽ trở lại Ayrton. Những người định cư thấy rằng Ayrton thành tâm sám hối những tội lỗi trong quá khứ của mình và anh ta cố gắng trở nên hữu ích với họ bằng mọi cách. Do đó, họ không có khuynh hướng đánh giá anh ta vì những hành vi sai trái trong quá khứ và sẵn sàng chấp nhận anh ta trong xã hội của họ. Tuy nhiên, Ayrton cần thời gian, và do đó, anh ta yêu cầu một cơ hội sống trong san hô mà những người định cư xây dựng cho động vật thuần hóa của họ ở một khoảng cách nào đó từ Cung điện Granit.
Khi con bot trở lại cơn bão từ đảo Tabor vào ban đêm, nó đã được cứu bởi một ngọn lửa, mà theo họ nghĩ, trôi nổi trên nó, đã bị bạn bè của chúng chọc ghẹo. Tuy nhiên, hóa ra họ không liên quan đến việc này. Nó cũng chỉ ra rằng Ayrton đã không ném một chai ghi chú xuống biển. Người định cư không thể giải thích những sự kiện bí ẩn này. Họ ngày càng nghiêng về ý tưởng rằng, ngoài họ, trên đảo Lincoln, khi họ đặt tên cho anh ta, còn có một người khác, ân nhân bí ẩn của họ, thường đến giúp đỡ họ trong những tình huống khó khăn nhất. Họ thậm chí bắt tay vào một cuộc thám hiểm tìm kiếm với hy vọng tìm được nơi ở của anh ta. Tuy nhiên, việc tìm kiếm kết thúc vô ích.
Mùa hè năm sau (kể từ khi Ayrton xuất hiện trên đảo của họ, và trước khi anh kể cho họ nghe câu chuyện của mình, năm tháng đã trôi qua và mùa hè đã kết thúc, và nó rất nguy hiểm khi đi thuyền trong mùa lạnh), họ quyết định quay trở lại Quần đảo Tabor để lại một ghi chú trong túp lều. Trong ghi chú, họ có ý định cảnh báo thuyền trưởng Glenarvan nếu anh ta quay lại rằng Ayrton và năm nạn nhân bị đắm khác đang chờ được giúp đỡ trên một hòn đảo lân cận.
Những người định cư đã sống trên đảo của họ trong ba năm. Cuộc sống của họ, nền kinh tế của họ đạt đến sự thịnh vượng. Họ đã thu hoạch những vụ mùa lúa mì phong phú được trồng từ một loại hạt, được tìm thấy trong túi Harbert, cách đây ba năm, xây dựng một nhà máy, chăn nuôi gia cầm, trang bị hoàn toàn nơi ở của họ, làm quần áo ấm và chăn mới cho họ từ len muckyon. Tuy nhiên, cuộc sống yên bình của họ bị lu mờ bởi một sự cố đe dọa đến cái chết. Một lần, nhìn ra biển, họ thấy một con tàu được trang bị tốt ở đằng xa, nhưng một lá cờ đen bay phía trên con tàu. Con tàu neo đậu ngoài khơi. Nó cho thấy những khẩu súng tầm xa đẹp. Ayrton lẻn vào con tàu dưới màn đêm để thực hiện trinh sát. Hóa ra là có năm mươi tên cướp biển trên tàu. Một cách kỳ diệu trượt khỏi họ, Ayrton trở lại bờ biển và nói với bạn bè rằng họ cần chuẩn bị cho trận chiến. Sáng hôm sau hai chiếc thuyền hạ xuống khỏi con tàu. Ngày đầu tiên, những người định cư bắn ba người, và cô trở về, vùng đất thứ hai nằm trên bãi biển và sáu tên cướp biển còn lại đang trốn trong rừng. Các khẩu pháo được thiêu rụi từ con tàu, và nó đến gần bờ hơn nữa. Dường như không có gì có sức mạnh để cứu một số ít người định cư. Đột nhiên, một con sóng khổng lồ dâng lên dưới con tàu, và nó chìm xuống. Tất cả cướp biển trên đó chết. Hóa ra sau đó, con tàu đã bị nổ tung bởi một quả mìn và sự kiện này cuối cùng đã thuyết phục người dân trên đảo rằng họ không đơn độc ở đây.
Lúc đầu, họ sẽ không tiêu diệt những tên cướp biển, muốn cho họ cơ hội để có một cuộc sống yên bình. Nhưng hóa ra những tên cướp không có khả năng này. Họ bắt đầu cướp và đốt các hộ gia đình định cư. Ayrton đến san hô để thăm thú. Cướp biển bắt anh ta và đưa anh ta đến một hang động, nơi họ muốn tra tấn anh ta để đồng ý đến bên họ với sự tra tấn. Ayrton không bỏ cuộc. Bạn bè của anh ta đến trợ giúp anh ta, nhưng bị thương nặng ở san hô Harbert, và những người bạn của anh ta vẫn ở trong anh ta, không thể quay lại với chàng trai trẻ sắp chết. Sau vài ngày, họ vẫn rời khỏi Cung điện Đá hoa cương. Kết quả của quá trình chuyển đổi, Harbert bắt đầu một cơn sốt ác tính, anh ta sắp chết. Một lần nữa, sự quan phòng can thiệp vào cuộc sống của họ và bàn tay của người bạn bí ẩn tốt bụng của họ ném cho họ loại thuốc cần thiết. Harbert đang hồi phục hoàn toàn. Những người định cư dự định sẽ ra đòn cuối cùng cho những tên cướp biển. Họ đến san hô, nơi họ dự định tìm thấy chúng, nhưng tìm thấy Ayrton, người đã kiệt sức và hầu như không còn sống, và gần đó, xác chết của những tên cướp. Ayrton báo cáo rằng anh ta không biết làm thế nào anh ta kết thúc trong san hô, người đã đưa anh ta ra khỏi hang và giết chết những tên cướp biển. Tuy nhiên, anh báo một tin buồn. Một tuần trước, bọn cướp đã đi biển, nhưng, không biết cách điều khiển bot, đã phá vỡ nó trên các rạn san hô ven biển. Chuyến đi đến Tabor phải hoãn lại cho đến khi việc chế tạo một phương tiện mới. Trong bảy tháng tiếp theo, người lạ bí ẩn không cảm thấy gì. Trong khi đó, một ngọn núi lửa thức dậy trên đảo, mà thực dân cho rằng đã chết. Họ đang chế tạo một con tàu lớn mới, nếu cần thiết, có thể đưa họ đến vùng đất có người ở.
Một buổi tối, khi chuẩn bị đi ngủ, cư dân của Cung điện Granit nghe thấy một tiếng chuông. Máy điện báo mà họ đã sử dụng từ san hô đến nhà của họ đang hoạt động. Họ đang khẩn trương gọi vào san hô. Ở đó, họ tìm thấy một ghi chú yêu cầu họ đi dọc theo dây phụ. Dây cáp dẫn họ đến một hang động khổng lồ, nơi mà sự kinh ngạc của họ, họ nhìn thấy một chiếc tàu ngầm. Trong đó, họ gặp chủ nhân và người bảo trợ của họ, đội trưởng Nemo, hoàng tử Ấn Độ Dakkar, người đã chiến đấu cho sự độc lập của quê hương mình suốt cả cuộc đời. Ông, đã là một người đàn ông sáu mươi tuổi, người chôn cất tất cả các cộng sự của mình, sắp chết. Nemo đưa cho những người bạn mới một chiếc quan tài có trang sức và cảnh báo rằng khi núi lửa phun trào, hòn đảo (như cấu trúc của nó) sẽ nổ tung. Anh ta chết, những người định cư bật lên những chiếc thuyền và hạ nó xuống dưới nước, và họ chế tạo con tàu mới không mệt mỏi suốt cả ngày. Tuy nhiên, họ không có thời gian để hoàn thành nó. Tất cả sự sống bị diệt vong trong vụ nổ của hòn đảo, từ đó chỉ còn lại một rạn san hô nhỏ trong đại dương. Những người định cư, người đã qua đêm trong một chiếc lều trên bờ, bị ném xuống biển bởi một làn sóng không khí. Tất cả trong số họ, ngoại trừ Jupe, vẫn còn sống. Trong hơn mười ngày họ đã ngồi trên rạn san hô, gần như chết vì đói và không còn hy vọng điều gì nữa. Đột nhiên họ thấy một con tàu. Đây là Duncan. Anh cứu tất cả mọi người. Khi nó quay ra, Thuyền trưởng Nemo, trong khi bot vẫn an toàn, đã thả nó lên Tabor và để lại một lời nhắn cho những người cứu hộ.
Trở về Mỹ để lấy đồ trang sức do Thuyền trưởng Nemo tặng, bạn bè mua một mảnh đất lớn và sống trên đó giống như cách họ sống trên đảo Lincoln.